A、该细胞处于减数第二次分裂后期,没有同源染色体,含两对相同染色体,A错误;B、该细胞中有两个染色体组,l与3为一组,2与4为一组,B错误;C、该细胞分裂后产生的子细胞是生殖细胞,因而其染色体数目比体细胞要减少一半,C正确;D、由于同源染色体在减数第一次分裂后期分离,且1与2、3与4是复制关系,所以如果1是Y染色体,则2也是Y染色体,3与4为常染色体,D错误.故选:C.