岳飞死后，武穆遗书一直藏于临安大内翠寒堂东十五步处水帘石洞下，后被铁掌帮帮主上官剑南盗回铁掌峰，藏于帮中圣地。
《射雕英雄传》一书中完颜洪烈见金跟蒙古战斗屡屡不敌，希望得到遗书中用兵要决以灭蒙古及大宋；故请得欧阳锋父子及彭连虎、沙通天等武林高手帮助，前往水洞盗书。惟他们不知遗书原本早已被铁掌帮帮主盗去，所夺得的只是一个空盒。郭靖亦为保护此书，与欧阳锋交手而至重伤；得黄蓉相助于密室疗伤七天后方愈。
郭靖与黄蓉因于牛家村曲灵风酒店中发现曲藏有遗书所在地的画，得知遗书藏于铁掌峰，并成功取得。襄阳城破后，郭靖夫妇与襄阳同生死，郭靖将杨过送予郭襄的玄铁重剑加上西方精金分别鋳成倚天剑与屠龙刀，武穆遗书即藏于屠龙刀之中。
元明：周芷若于灵蛇岛取得倚天剑与屠龙刀，刀剑互砍而取得武穆遗书，后赵敏从周身上取得遗书，张无忌再转交予徐达。
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