巴林林业局建于1956年,其前身是雅鲁森林经营局,1958年5月经内蒙古自治区批准,将经营局改为雅鲁林业局,局址由扎兰屯镇迁至牙克石市的巴林镇,1960年6月经内蒙古大兴安岭林业管理局批准雅鲁林业局改称巴林林业局。
1962~1963年国民经济调整,巴林林业局“下马”精简人员。1964年3月,经内蒙古自治区批准,在巴林设立岭南林业管理局,辖有“五局一场”,即免渡河、乌奴耳、巴林、南木、五岔沟林业局和白狼林场,1968年撤销岭南林业管理局,巴林林业局隶属呼盟林业林管局,1969年行政区划变动后,归属黑龙江省营林局,1979年恢复内蒙古行政区划后,归内蒙古林业局,1980年8月归呼盟林业管理局。 1956年3月建立柴河森林经营局,隶属于呼盟林业局。1958年11月撤销经营局改为柴河林场,并将原所属巴什河经营所划归大兴安岭林业管理局的绰尔林业局。柴河、固里河、哈多河、莎马街4个经营所归属扎兰屯市(原布特哈旗)林业局。
1970年呼伦贝尔盟在柴河建立后方基地,组成山区建设指挥部,同时筹建柴河林业局,领导柴河、固里河、哈布气3个林场。1971年撤销山区建设指挥部,正式成立柴河林业局,归扎兰屯市政府领导。1980年8月柴河林业局隶属关系归呼盟林管局直接领导。 1956年在红花尔基建立伊敏森林经营局,下设6个林场。1958年森工营林机构合并,撤销伊敏经营局,将所辖的辉河、维纳河、西尼河、红花尔基林场下放给鄂温克旗林业局;巴日图、罕达盖林场下放给新巴尔虎左旗林业局。
1970年1月21日经黑龙江省革命委员会批准,成立红花尔基林业局,经营管理贯穿于鄂温克旗和新巴尔虎左旗境内的樟子松林带。1970年5月15日经呼盟批准,成立了革命委员会,1981年改称为林业局。