与公司的合同纠纷，人民法院已经有生效判决的债务款的支付方式要看具体情况的。如果是判决生效后，人民法院法院还没有开始强制执行的，债权人是公司的，债务人应把债务款打入债权人公司的基本账户中。如果是判决生效后，人民法院执行部门已经发出强制执行通知书的，债务人一般应把债务款打入人民法院法院执行部门的账户里为妥。
