多系统萎缩的病因目前尚不明确。
多系统缩(MSA)是一组成年期发病、散发性的神经系统变性疾病，临床表现为不同程度的自主神经功能障碍、对左旋多巴类药物反应不良的帕金森综合征、小脑性共济失调和锥体束征等症状。目前认为MSA的发病机制可能有两条途径：一是原发性少突胶质细胞病变假说，即先出现以α-突触核蛋白阳性包涵体为特征的少突胶质细胞变性，导致神经元髓鞘变性脱失，激活小胶质细胞，诱发氧化应激，进而导致神经元变性死亡；二是神经元本身α-突触核蛋白异常聚集，造成神经元变性死亡。α-突触核蛋白异常聚集的原因尚未明确，可能与遗传易感性和环境因素有关。
多系统萎缩患者的合并症：常见有晕厥，并发头颅或全身外伤，抑郁症，精神行为异常，不同程度的痴呆和脂溢性皮炎等。另外，多系统萎缩患者应注意继发的肺部感染、尿路感染等。并有睡眠障碍，包括睡眠呼吸暂停、睡眠结构异常和REM睡眠行为异常等。
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