(1)圆C:x2+y2-2x-4y-12=0可化为圆C:(x-1)2+(y-2)2=17,圆心为(1,2),
∵以PQ为直径的圆的面积最大,
∴直线l过点(1,2),
∵直线l过A(3,0),
∴直线l的方程为x+y-3=0;
(2)设直线l的方程为y=k(x-3),以PQ为直径的圆的方程为x2+y2-2x-4y-12+λ(kx-y-3k)=0
(0,0)代入圆,整理可得-12-3λk=0,①
圆心坐标为(1-
,2+λk 2
),代入y=k(x-3),可得2+λ 2
=k(1-λ 2
-3),②λk 2
由①②可得λ=-1,k=4,
∴直线l的方程为y=4(x-3).