A、据化学式为C4H6N2知，该物质中碳、氢、氮三种元素的原子个数比为4：6：2，故A错误；
B、据化学式为C4H6N2知，该物质的每个分子是由4个碳原子、6个氢原子、2个氮原子构成，但不是该物质是由4个碳原子、6个氢原子、2个氮原子构成，故B错误；
C、该物质是由分子构成，每个分子由碳、氢、氮三种原子组成，故C错误；
D、根据碳元素的质量分数=
×100%=元素的质量 分子的质量
×100%≈58.5%，故D正确．12×4 12×4+1×6+14×2
故选：D
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