（1）题干分析可知：对比A与B实验结果可知：种子的萌发需要一定的温度；对比B与C，酸雨影响种子的萌发，因此该实验要探究的问题是酸雨和温度对种子的萌发的影响．
（2）发芽率是指发芽的种子粒数占种子总粒数的百分之几，进而用：
×100%=发芽率，由此列式种子发芽数量 种子总数
×100%=90%．45 50
（3）根据分析可知：A和B以温度为变量形成一组对照实验，目的是探究温度对种子萌发的影响；B与C以酸雨为变量形成一组对照实验，目的是探究酸雨对种子萌发的影响．
故答案为：（1）酸雨；温度；（2）90%；（3）适宜的温度；酸雨不利于种子的萌发．
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