A、房屋倒塌的过程中只是形状发生了变化，没有新物质生成，属于物理变化；B、路桥断毁的过程中只是形状发生变化，没有新物质生成，属于物理变化；C、山体滑坡的过程中只是位置的移动，没有新物质生成，属于物理变化；D、生物腐败的过程中有新物质菌类物质生成，属于化学变化．故选：D．
