Tomcat 配置的数据源，测试连接数据库报告类转换错误。

Connection con = (Connection) ds.getConnection();

Connection 应该是 java.sql.Connection. 但是你用的是： com.mysql.jdbc.Connection

tomcat的数据源的PoolGuardConnectionWrapper 实现的是 java.sql.Connection. 你把它转换为 com.mysql.jdbc.Connection肯定出错

Statement 必须用 java.sql.Statement

文件夹：build-存放编译后的class文件
nbproject-存放项目的具体配置文件
src-java源代码存放文件夹
test-JUnit测试文件存放位置

Build.xml构建描述文件，因为Netbeans的编译打包是基于ant的，build就是ant实现自动编译打包的描述文件。
manifest.mf是打包的时候需要的一个清单文件，是对打包后的jar包中的文件的一个描述下文件。
original.java，.netbeans_automatic_build，这两个文件不知道你用的什么Netbeans版本，在我的版本中并未生成此文件。
build-impl.xml是对Build.xml文件的具体描述，Build.xml其实并未实现具体的ant构建脚本，具体是在该文件中实现的，如果你看过build.xml的源代码，就会发现一句，这你就知道是什么意思了。

你需要把你的mysql数据库的jar“mysql-connector-java-3.2.0-alpha-bin.jar”拷到tomcat根目录下的common\lib下面去

你试下注册驱动的时候不要用Class.forName();
换一种方式。好像是DirverManager什么的 记不太清 你试试吧

连接包导出项目lib下了吗？发布的时候一定要导入呢