疑犯追踪第二季第16集没看懂,求解释.

2年前肖和搭档科尔被派去做掉丹尼尔·阿基诺，此人是负责给机器造核电站作为能源供给的知情人（黄色框），但“他问太多问题”，于是被冠以叛国罪。但后来科尔查到阿基诺的资金来源，然后跟他们头头威尔森表示了怀疑，因为科尔的调查有可能暴露机器，于是威尔森等人决定杀掉肖和科尔，所以他们两个成了里斯和芬奇的POI。后来肖杀掉威尔森为科尔报了仇，但是在街上被赫什注射乌头碱，卡特、弗斯科和伪装成救护人员的莱昂·陶救出了肖，并且伪造了肖的死亡。这是主线剧情。根妹之前已经潜入特别检察官办公室做秘书（15集），本集里她诱使科尔调查阿基诺，并且向肖逼供，意图找出机器所在的位置。还有什么不懂的吗？

就是finch他们是管机器吐出的无关人员的号码（就是没有危害到国#家安全的，只是个人的）肖女士和她搭档是替政府解决相关人员的号码，但是他们自己不完全知道是怎么回事，不知道机器的存在。后来他们杀了一个人（察觉到机器的人）男搭档起疑心了，政#府要灭他们俩~finch他们把肖救了

《疑犯追踪》第二季第16集的剧情主要是关于肖恩和ROOT之间的互动和计划。
肖恩被军方抓获后，被注射了一种可以控制他的药物。ROOT知道这一点，并计划通过肖恩的手机信号发射器来追踪他的位置。
然而，肖恩最终逃脱了，并反过来开始追踪Root。Root为了保护自己的位置，开始让肖恩相信她已经被军方杀害。
在第十六集中，肖恩找到了Root的藏身之处，但发现她并没有死。Root向肖恩解释了她的计划，并希望他能够帮助她摆脱军方的控制。
肖恩同意帮助Root，并最终成功地破坏了军方通过药物控制他的系统。Root和肖恩最终一起离开了藏身之处，开始寻找新的线索和证据。
总的来说，第十六集的剧情是关于肖恩和ROOT之间的信任和合作，以及他们如何一起对抗军方的故事。