A、分子和原子都在不停运动；故A说法错误；B、在化学变化中分子可分而原子不可分；故B说法正确；C、分子之间有间隔，原子之间也有间隔；故C说法错误；D、分子的质量和原子的质量无法比较大小，有的分子比有的原子大，有的原子比有的分子大，故D说法错误．故选B．
