开展新生儿疾病筛查是保护儿童健康，提高福建省出生人口素质的具体措施之一。根据《 中华人民共和国母婴保健法 》的有关规定，福建省卫生厅决定2002年起在全省设立两个分中心，泉州市妇幼保健院是分中心之一，负责泉州、三明两市的新生儿疾病筛查、治疗工作。
麻醉科、手术室亦是我院的特色和优势，其硬件设施、工作流程与国际接轨，设备配置堪称国内一流，是“全国小儿麻醉专科培训基地” 。
口腔科、外科、五官科、妇产科、检验科全面向成人开放，能提供各种疾病的诊疗与手术服务。
近年来，医院坚持以市场为导向，走临床与保健机构结合的道路，业务建设超常规发展，连续十年年均经济增长超过25%。十五年来，全院在国家、省级刊物发表学术论文900多篇，21个课题24次荣获省、市、厅级科技进步奖，近三年来，两人入选“中华牌”医学杂志编委，三人入选中华医学会专科学组委员，医院集体和个人多次荣获国家级表彰，硕果累累，成绩斐然。
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