A、图中可以看出，同源染色体上非姐妹染色单体之间发生了交叉互换，A正确；B、B与b这对等位基因分离发生在减数第一次分裂后期，B正确；C、由于发生交叉互换，等位基因A与a的分离不只发生在减数第一次分裂后期，也发生在减数第二次分裂后期，C正确；D、由于发生交叉互换，等位基因A与a的分离不只发生在减数第一次分裂后期，也发生在减数第二次分裂后期，D错误．故选：D．
