A、三倍体西瓜由于同源染色体是奇数条,因此减数分裂时会发生联会紊乱,因此不能形成正常的配子,A错误;B、X和Y染色体虽然形态大小不同,但是属于一对同源染色体,因此在减数分裂过程中会发生联会现象,B正确;C、基因重组不能产生新基因,因此不会丰富基因库,C错误;D、由于四倍体的植株的基因型未定,因此不能确定获得的单倍体植株是否是纯合子,D错误.故选:B.